使用opentrons Flex 自動化移液設備做 蛋白質 質譜前處理
自動化盤面布局:
| 盤面位置 | 1 | 2 | 3 | Extension deck | Opentrons Flex pipette and gripper |
|---|---|---|---|---|---|
| A | Thermocycler Module(PCR) 熱循環模組 | Flex single channel pipette 50uL | |||
| B | 1000uL tips | 50uL tips | 200uL tips | Flex 8 channel pipette 5-1000uL | |
| C | Temperature module 溫度模組 | Centrifuge tube rack 離心管架 | Absorbance Plate Reader Module 盤式分析模組 | Flex gripper | |
| D | Heater-Shaker Module 熱震盪模組 | magnetic module 磁化模組 | 12 Well Reservoir 12排 藥品槽 |
背景介紹
在蛋白質組學研究中，樣品前處理是影響下游質譜分析結果準確性與重現性的重要步驟。從樣品設計、蛋白質定量、質譜分析到生物信息學分析，每個步驟都需要高度的精確性。特別是在高通量分析中，樣品前處理的重現性和一致性直接影響數據的可信度和分析結果的穩定性。
面臨的挑戰
- 操作步驟繁多，耗時耗力
傳統的蛋白質樣品前處理涉及多個步驟，如樣品準備、蛋白定量、還原與烷基化、酶解、脫鹽純化、乾燥、定量和上機等，繁瑣且耗費大量人力和時間。 - 人工誤差影響分析準確度
在高通量數據分析中，微小的人工操作誤差會導致數據偏差，影響分析結果的重現性和精確度，特別是在 BCA 定量、還原與烷基化和酶解過程中。 - 實驗室間差異性較大
不同操作人員和不同實驗室之間的準確性和重現性存在較大差異，使得數據對比和分析的可靠性降低。
關鍵問題與解決方案：自動化前處理工作站
如何 簡化樣品前處理操作，減少人為誤差對數據質量的影響，並 提高分析效率和可靠性？
Opentrons 自動化工作站 為蛋白質譜前處理提供了全自動化解決方案，有效解決傳統手工操作的痛點，顯著提升實驗效率和數據重現性。
- 自動化處理優勢
- 減少人為誤差：自動化操作確保每一步驟的精確性和一致性，大幅減少手工操作誤差。
- 提高實驗效率：自動化工作站顯著縮短實驗準備時間。例如，BCA 定量從傳統手工操作的 1 小時縮短至 15 分鐘，蛋白酶解過程則從 4-16 小時減少至 20 分鐘。
- 提升重現性和穩定性：自動化流程標準化，保證數據重現性和實驗結果的一致性。
樣品前處理流程概覽
- 樣本/試劑準備 (Sample/Buffer Preparation)
- 蛋白定量 (Protein Quantification, 如 BCA Assay)
- 均一化 (Normalization)
- 還原與烷基化 (Reduction and Alkylation)
- （可選）SP3 純化 (SP3 Purification) 或 C18 脫鹽 (C18 Desalting)
- 酶解 (Enzymatic Digestion)
- 乾燥 (Drying)
- 定量 (Quantification)
- 點板 (Spotting)
- 上機分析 (Mass Spectrometry Analysis)
蛋白質純化 自動化與手工操作時間對比
| 步驟 | 手工操作時間 | 自動化準備時間 | 解離時間 |
|---|---|---|---|
| BCA 定量 | 1 小時 | 15 分鐘 | 30 分鐘 |
| 均一化 | 1 小時 | - | - |
| 還原與烷基化 | 30 分鐘 | - | 30 分鐘 |
| 酶解 | 30 分鐘 | - | 4-16 小時（過夜） |
| 脫鹽或去污 | 3-5 小時 | 20 分鐘 | 4.5-16 小時 |
| 總計（不含解離） | 5-7 小時 | 約 50 分鐘 | 4.5-16 小時 |
為何選擇 Opentrons 自動化工作站？
- 高效精準：自動化操作減少人為誤差，確保每一步驟的一致性和準確性。
- 靈活適應：適用於各種蛋白質譜前處理流程，輕鬆應對不同樣品和實驗需求。
- 易於操作：簡單直觀的操作介面，即使是非專業技術人員也能輕鬆上手。
若您對 Opentrons 自動化工作站 在蛋白質譜前處理中的應用感興趣，歡迎 聯繫寅發企業有限公司 獲取更多資訊與技術支援！